5. 按照正確的流動(dòng)方向?qū)⑸V柱連接到液相系統(tǒng)上；

6. 如果有機(jī)物不是正常流動(dòng)相的一部分的話，要使用3個(gè)柱體積的超純水沖洗色譜柱

以去除有機(jī)物；

7. 使用上樣緩沖液進(jìn)行柱平衡（通常使用3——5個(gè)柱體積）；

8. 使用QC 測試方法評價(jià)柱子的性能，以確保色譜柱能夠正常使用。

除鹽：對普通反相 C18 鍵合相柱，為除去柱中含有的緩沖鹽類或水溶性物質(zhì)時(shí)，不應(yīng)使用純水沖洗。因?yàn)?C18 鍵合相像一條長鏈將硅膠黏結(jié)，當(dāng)有有機(jī)溶劑存在時(shí)，其表面被流動(dòng)相潤濕， C18 長鏈*展開，像海水中的海藻一樣。當(dāng)純水或緩沖溶液通過時(shí)， C18 鍵合相不能被浸潤，鍵合相表面會(huì)塌陷，從而將溶劑、樣品分子或無機(jī)鹽分子包合。此時(shí)僅用純水無法將包合物洗脫出，應(yīng)使用含 5 ％有機(jī)溶劑的水溶液沖洗，以清除無機(jī)鹽或水溶性物質(zhì)。

蛋白污染：如果需從硅膠鍵合固定相清洗蛋白質(zhì)殘留物，必須使用和前述不同的程序。如果生物材料血漿或血清樣品注入色譜柱，在大多數(shù)情況下，純有機(jī)溶劑 ( 如乙腈或甲醇 ) 并不能溶解肽和蛋白質(zhì)，用它們清洗色譜柱是無效的。然而，有時(shí)使用有機(jī)溶劑與緩沖物、酸或離子對試劑的混合物卻是有效的。

由于污染物聚集在色譜柱頭，逆向沖洗會(huì)縮短污染物在柱中遷移的距離；又因?yàn)樯V柱皆在高于操作壓力下填充的，通常逆向液流不會(huì)擾動(dòng)色譜柱床。但如果色譜柱頂端過濾篩板的孔徑大于柱底部過濾篩板的孔徑，則固定相的微小粒子會(huì)在逆向沖洗過程通過篩板流出柱，從而會(huì)在柱中產(chǎn)生新的死空間引起柱床松動(dòng)。因此在逆向沖洗前，應(yīng)先確認(rèn)柱管兩端過濾篩板的孔徑一致。